Le Comité de Pilotage est l’enceinte de discussion et d’élaboration des décisions liées au développement du programme. Il approuve notamment chaque année le budget et le programme des activités. Il se réunit au moins deux fois par an, dont une fois à l’occasion de la session annuelle du programme.

Le Comité de Pilotage est composé, outre les membres fondateurs du bureau, de personnalités choisies pour le rôle important qu’elles jouent dans les relations politiques, économiques et culturelles entre la France et la Chine dans le domaine de la santé.